Los habitantes y amantes de la música de Pepperland, se encuentran sitiados por los Blue Meanies, un desagradable grupo de criaturas que odian la música. El alcalde de Pepperland (Dick Emery) manda al marinero Old Fred (Lance Percival) a Liverpool, Inglaterra, en donde les pide ayuda a los Beatles (John Lennon, Paul McCartney, George Harrison, Ringo Starr). Los Beatles viajan en un submarino amarillo hasta la ocupada Pepperland, en donde los Blue Meanies no pueden contra las melodías del grupo.